בפסיקה, קיימים מקרים בהם נפסק פיצוי נזיקי בגין פגיעה בזכויות חוקתיות. כך למשל, בע"א 93/2781 מיאסה עלי דעקה נ' בית החולים "כרמל" חיפה, פ"ד נג (4) 526 (1999, להלן: עניין דעקה), התקבלה טענת התובעת, כי האוטונומיה שלה נפגעה בכך שלא התקבלה הסכמתה מדעת לניתוח. בית המשפט הכיר בנזק של פגיעה באוטונומיה כנגזרת של הזכות החוקתית לכבוד האדם, במסגרת עוולת הרשלנות (על קליטת הזכויות החוקתיות למשפט הפרטי ראו להלן). התובעת פוצתה בגין פגיעה זו באופן נפרד מהפיצוי שנפסק לה בגין הנזקים שנגרמו מהניתוח. כב' השופטת ט' שטרסברג כהן הבהירה, כי הפיצוי ניתן, בראש נזק זה, בגין הפגיעה בזכות החוקתית כראש נזק
--- סוף עמוד 194 ---
עצמאי במסגרת עוולת הרשלנות (כב' השופטת שטרסברג כהן הייתה בדעת מיעוט אך לא בשאלה זו), בפסקה 42 לפסק דינה היא מבהירה:
"אכן, ניתן להגן על זכותו של אדם לאוטונומיה בכלל, ולקבלת מידע רפואי בפרט, גם בגדרה של עילת תביעה בגין פגיעה בזכות יסוד בעלת חשיבות עליונה, שכמוהָ כעוולה חוקתית. פיתוחן של עילות תביעה הסבות על הפרת זכויות יסוד ופגיעה בהן, הינו נושא מורכב העושה עתה אך את צעדיו הראשונים במשפט הישראלי. הכרה בקיומן של עילות תביעה חוקתיות מעוררת שלל קשיים ושאלות שטרם זכו לליבון ולדיון בפסיקת בתי-המשפט ובכתיבת המלומדים, כגון אילו זכויות יהיו מושא להגנה על-ידי עילות חוקתיות; מה הם המבחנים להגנה על זכויות אלה; מה הם הסעדים ההולמים פגיעה בזכות חוקתית וכדומה. במצב דברים זה, כאשר סוגיות אלה טרם נדונו לעומקן, ראוי ללכת במסלול אחר ההולם את פתרון הבעיה העומדת בפנינו, ודי לנו לקבוע כי זכותו של אדם לאוטונומיה תזכה להגנה באכסניה המשפטית של ראש נזק עצמאי ונפרד מראשי הנזק המוכרים בגדרה של עוולת הרשלנות. ההכרעה בשאלה הנכבדה אם יש מקום ליתן הגנה לזכות לאוטונומיה גם בגדרה של עילת תביעה עצמאית, ראוי לה שתישאר לעת מצוא."
בדעת רוב נקבע, כי הפיצוי בגין פגיעה באוטונומיה יתווסף על הפיצוי בגין נזקי גוף שנגרמו לתובעת.
שאלת הפיצוי בגין הפגיעה באוטונומיה התעוררה בפרשת הסיליקון בחלב של תנובה (ע"א 08/10085 תנובה - מרכז שיתופי נ' עזבון המנוח תופיק ראבי ז"ל (2011)). לעניין הפיצוי, קבעה כב' השופטת א' חיות (בפסקה 34 לפסק דינה בעמ' 45), כי:
"חשוב להדגיש כי בעניין דעקה סווגה הפגיעה באוטונומיה כראש נזק לא ממוני במסגרת עוולת הרשלנות ולא כעוולה עצמאית העומדת על רגליה היא. לאחר שניתן פסק הדין בעניין דעקה הובעה אמנם הדעה כי מן הראוי לסווג פגיעה באוטונומיה כעוולה חוקתית המקימה עילת תביעה .... אולם סוגיה נכבדה זו המבקשת להכיר בעוולה חדשה יציר הפסיקה, טרם נדונה לעומקה בפסיקתנו והמקרה דנן אינו מצריך דיון והכרעה בה."