בנושא הרישיונות נקבע בעיקרי המתווה, כי על כל פעולה בקנאביס לעמוד בהוראות הדין, לרבות קבלת רישיונות מתאימים שתספק היחידה לקנביס רפואי (להלן - היק"ר), בהתאם להוראות פקודת הסמים. תנאי הרישיונות יקבעו דרישות איכות ואבטחה וכן תנאים על-פי המלצות המשרד לביטחון פנים ומשטרת ישראל, שתבחן היעדר מידע הפוסל את אפשרות מתן הרישיון (סעיף 3.א).
בעניין בתי מרקחת נקבע בעיקרי המתווה, כי "מוצרי הקנביס יונפקו למטופלים בבתי מרקחת שיבקשו לעשות כן ויעמדו בתנאים הנדרשים". נקבע כי ניפוק מוצרי קנביס וניהולו הרוקחי ייעשה כמקובל לגבי תרופות נרקוטיות (סמים מסוכנים) בשינויים המחויבים ורק על-פי הוראות המשרד. כמו כן נקבע כי תינתן הדרכת רוקח למטופלים בכל הנוגע לשימוש במוצרי הקנביס (סעיף 3.ו).
- בהתאם להחלטת הממשלה פורסמו אמות המידה המקצועיות לעיסוק בתחום הקנביס וכן נקבעה "מפת דרכים" בעניין העיסוק בתחום - "הנחיות תהליך רישוי העיסוק בתחום הקנביס לשימוש רפואי ('מפת דרכים') - נוהל 107" (להלן - הנחיות הרישוי). הנחיות אלו מתעדכנות מעת לעת והן זמינות באתר המרשתת של היק"ר. הנחיות הרישוי קובעות את תהליך הרישוי, המורכב מארבעת השלבים הבאים:
בשלב הראשון על היזם להגיש בקשה לאישור ראשוני בצירוף המסמכים הדרושים (סעיף 4.1.1).
בשלב השני נבחנת עמידת הבקשה בתנאי הסף והיעדר "מידע פוסל". מתקבלת המלצת המשטרה, המבוססת על הערכת מסוכנות פלילית ונעשית בדיקה ברשויות הרלוונטיות ובהן אגף הרוקחות, הרוקחות המחוזית ומשרד החקלאות, אם אין מידע פוסל לגבי מבקש הרישיון, בעלי העניין ועובדיו. אם אין מידע פוסל, היק"ר מנפיק קוד עוסק ואישור ראשוני לתחום העיסוק המבוקש.
בשלב השלישי היזם יכול להתחיל בהתאמת העסק לעיסוק המיועד, תוך עמידתו בכל דרישות הדין והנחיות הרישוי. עליו לקבל אישורים שונים, לרבות בדבר עמידה בתנאי איכות נאותים מתאימים, בדומה לאלו הדרושים לשם עיסוק בתכשירים רפואיים וכן אישורים בדבר עמידה בתנאי האבטחה הנדרשים. לאחר מכן הוא יוכל להגיש אל היק"ר בקשה לקבלת רישיון, שבו יפורטו שמות בעלי העניין, העובדים וכדומה והוא יוכל לקבל רישיון מוגבל בזמן בהתאם לסוג העסק, "המיועד לצרכי וולידציה בלבד" (סעיף 4.1.3 טו).
בשלב הרביעי נבחנת ביק"ר בקשת הרישוי על פי הוראות הדין והנחיות הרישוי ובהתאם לסוג העיסוק. בין השאר, נערכת בדיקה נוספת עם המשטרה, אם אין מידע מונע. בחינה זו נעשית גם לגבי בקשות לחידוש רישיונות או להוספת בעלי עניין או עובדים (על-פי סעיף 25ג בפקודת הסמים). אם הבקשה אושרה, היק"ר ינפיק רישיון לפי פקודת הסמים להחזקה ועיסוק בתחום הקנביס לשימוש רפואי, המותאם לסוג העסק והעיסוק. לרישיון מצורף נספח ב', הכולל את שמות האנשים המאושרים במסגרת הרישיון ורק הם רשאים לעסוק בו או לבוא עמו במגע
- פקודת הרוקחים (נוסח חדש), התשמ"א-1981 (להלן - פקודת הרוקחים) מסדירה את העיסוק ברוקחות, את פעילות בתי המרקחת ואת רישום התכשירים (תרופות). סעיף 10 בפקודה זו קובע כי הפעלת בית מרקחת מותנית בכך שהניהול המקצועי בו יהיה באמצעות רוקח אחראי שאושר לכך וכן כי הוא אחראי לכל הפעילות המקצועית בבית המרקחת ולמילוי הוראות הדין. רוקח אחראי אינו יכול לשמש בתפקיד זה ביותר מבית מרקחת אחד, והוא רשאי לייפות את כוחו של רוקח מורשה למלא את מקומו למשך תקופה שלא תעלה על ארבעה-עשר יום (סעיף 11).
הסמכויות לאשר מינוי רוקח אחראי בבית מרקחת, לבטלו או לדחות בקשת אישור הואצלו מהמנהל אל הרוקחים המחוזיים של המשרד (כהגדרתם בתקנות הרוקחים (תנאי פתיחה וניהול של בתי מרקחת וחדרי תרופות), ה'תשמ"ב-1982).