בכל הנוגע לאפשרות העברה משנית, נוכח אופן תפיסת המוצגים, העברתם, אריזתם ושמירתם בטרם הגעתם למעבדה, אמרה ד"ר בובליל כי צריך להפריד בין שני התהליכים. לדבריה, "יכול להיות מצב שבו הייתה העברה משנית על איזשהו חפץ, הייתה העברה משנית. והחפץ שיושב כרגע, [...] לא חשוב איפה נושא עליו DNA שהגיע בהעברה משנית. זה קרה הרבה לפני שמישהו תפס אותו. אחר כך תפסו אותו, ארזו אותו, העבירו אותו, זה לא קשור להעברה, העברה משנית התרחשה מתישהו בזמן. [...] אם ההגנה רוצה לשאול לגבי האפשרות שבמהלך המארז של המוצגים, במהלך התפיסה של המוצגים, כתוצאה מהתפיסה של המצגים חלה העברה זו טענה אחרת". עם זאת, הסכימה שקיימת חשיבות לאופן התפיסה, האריזה והשמירה. לצד זאת הבהירה שבחינת העברה משנית תלויה בתרחיש הנבחן, וכשהוצגו לה מספר תרחישים יכולה היתה להתייחס אליהם.
מבחינת מיקום הדגימות, סברה שצריך להיות הסבר כיצד הגיע הפרופיל למקומות שבהם אותר.
בלשונה, "המקומות שהוא בדרך כלל משאיר את הDNA שלו, הוא לא משאיר את הDNA שלו על הסוליה. ולכן אלה המקומות שאותם אנחנו בודקים. כשהתוצאה מתקבלת אז אני אומרת האפשרות הכי סבירה מבחינתי מבלי לדעת שום מידע נוסף, הכי סביר זה שמי שנמצא העל הלובש הוא המקור, הוא כנראה בעל הנעליים. מצד שני, יבוא הסבר אחר, יכול להיות שיש הסבר אחר, אני לא יודעת, אני לא מתיימרת לקבוע את זה".
על הנעל השנייה, מוצג 21 (21 -B) בפינה הימנית מעל השרוך (כאמור בעמ' 1187 ש' 17, ועמ' 1188 ש'1), "פה יצא המנוח, פרופיל מלא של המנוח. [...] מהדגימה הזאת ויוצא פרופיל מלא של המנוח".
ד"ר בובליל שבדקה את הנעל אמרה (1215, ש' 21), "אני אומרת באופן ודאי וחד משמעי, יש DNA של המנוח על הנעל הזאת". עם זאת, בהגינותה היא הבהירה שלא היתה יכולה לקבוע בוודאות שמדובר בדמו של המנוח, שכן בדיקה אחת (בלו סטאר) הצביעה על אפשרות שלפיה מדובר בדם, אך בדיקה אחרת (הקסגון) לא נתנה אינדיקציה כזו. זאת בניגוד לנטען מפי המאשימה בתחילה, שעל אחת הנעליים נמצא דמו של המנוח (21.2.22, עמ' 24, ש' 9-8). ראוי לציין כי אחת הנעליים נשלחה לבדיקה חוזרת, עקב מפגש של יוני חג'ג', ראש המפלג, עם המומחית ד"ר נורית בובליל במסגרת כנס מקצועי, ונוכח שיחה שהתקיימה בין השניים (ראו: ת/11, ת/34). המומחית אף אישרה שלא בחנה את שרשרת המוצג.
בחקירתה הנגדית הבהירה ד"ר בובליל שעם מעבדת מאגר ה-DNA במטה הארצי (של המשטרה) יש קשרי עבודה אינטנסיביים אך אין יחסי כפיפות או מרות. היא מקבלת פרטי פרופיל מהמאגר ולא יכולה לדעת אם הוא נכון או שגוי. ככל שידיעתה משגת, ונוכח האמור באתר הרלוונטי במרשתת, המעבדה במטא"ר עובדת על פי אישור מהרשות הלאומית להסמכת מעבדות. בדיקת הבלו סטאר שנעשתה מעידה על קיומו של דם, אך מקורו יכול להיות גם בחיה ולא בהכרח באדם. בדיקת ההקסגון הותירה סימן שאלה בדבר קיומו של דם, אך "הפרופיל הגנטי הוא פרופיל גנטי של המנוח, יש כאן חומר ביולוגי של המנוח. אין פה שאלה בכלל [...] לאו דווקא דם". היא אישרה שהיתה תערובת מסוימת, אך המרכיב העיקרי שבה הוא פרופיל של המנוח. כדבריה, "אני אומרת באופן ודאי חד משמעי, יש DNA של המנוח על הנעל הזאת". לשאלת בית המשפט אמרה שהיתה מודעת לכך שהמוצגים נמצאו ב"מסלול בריחה". כן אמרה שאספו אותם "בחוץ", היא לא התעניינה בדרך התפיסה.