17.6. דיון נוסף התקיים בוועדת המכרזים לאחר שתשובת העותרת הועברה ליועצים הפיננסיים של ועדת המכרזים ולמנהלי הפרויקטים של הקו הירוק והסגול, אשר מצאו כי תשובת העותרת סיפקה הסברים חלקיים ואכן לגביהם הצטמצם הפער, אך בקטגוריות המרכזיות עדיין נותרו פערים משמעותיים. בעקבות זאת הוחלט על ידי ועדת המכרזים להורות על הרחבת הבחינה שתחול על כלל עלויות ההקמה. לשם בדיקת סבירות ההצעה מינתה ועדת המכרזים את שבח הנדסה, שלא הייתה מעורבת בהליכי המכרז עד כה, ולה הבנה וניסיון רב בעלויות ביצוע עבודות רכבת קלה במטרופולין.
17.7. שבח הנדסה ביצעה בדיקה של עלויות ההקמה של רכבת קלה בגוש דן בהתבסס על תכולת העבודה בשני שלבים, תחילה במנותק מהצעת העותרת, ובשלב שני בחנה אם קיים פער בין הערכתה לבין התמחור בהצעת העותרת. על פי ממצאי הדו"ח, עלויות ההקמה של העותרת בקו הירוק נמוכות בכ-1.36 מיליארד ש"ח מהעלויות הריאליות ובכ-580 מיליון ש"ח מהעלויות המינימליות (הגבול התחתון לעלויות ביצוע הפרויקט, המגלם עלויות כמעט ללא רווח וללא מרחב תמרון להתמודד עם תקלות), ובקו הסגול נמוכות בכ-970 מיליון ש"ח מהעלויות הריאלית ובכ-430 מיליון ש"ח מהעלויות המינימלית. עוד נמצא כי הצעת העותרת נמוכה בהרבה מהעלויות המינימליות, והרחק מתחת להצעות האחרות הקרובות אליה ביותר אשר עמדו בין הגבול המינימאלי לריאלי של העלויות. גם ההערכה התקציבית שערכה נת"ע עובר לפרסום המכרז גבוהה ב-10% מהעליות הראליות בקו הירוק ובכ-15% מהעלויות הראליות בקו הסגול.
17.8. לאחר דיון בדו"ח שבח, החליטה ועדת המכרזים לבדוק אם ניתן להפחית מעוצמת החשש באמצעים אחרים, כגון זהות בעלי המניות בעותרת, איתנות פיננסית וניסיון, מכתבי הכוונות של המממנים, רכיב התחזוקה וכיוצ"ב, תוך שהיא מודעת לאפשרות של שיקולים אסטרטגיים שונים, כגון אינטרס כניסה לתחום, ניצול כוח אדם בתקופה שיש בה פחות עבודה, לרבות מוכנות לחתוך ברווח או אפילו לסבסד, אולם הוחלט בסופו של דבר כי הכול עניין של "מידה", וכי ההסברים ה"ממתנים" עשויים היו להפיג חששות אילו היה מדובר בפער של סכום נמוך, אולם לא כך הדבר בענייננו. לא רק שהחששות לא הופגו אלא שדו"ח שבח אף הגבירם.
17.9. לפיכך, פנתה ועדת המכרזים לעותרת, צירפה את דו"ח שבח והודיעה כי היא עדיין שוקלת לפעול בהתאם לסעיף 7.6.5 למכרז (הודעה מיום 18.10.2021). לאחר שורה של התכתבויות ובקשות, הגישה העותרת מענה נוסף מפורט המחזיק מאות עמודים בצירוף התייחסות לדו"ח שבח של ארבעה מומחים מטעמה, וגם מכתבי כוונות מעודכנים מהגורמים המממנים (מענה מיום 23.11.2021).
17.10. בהמשך, על פי בקשתה של ועדת המכרזים, הגישו יועצי הוועדה התייחסות עניינית לכל אחת מחוות הדעת שצורפו למענה העותרת, וכן התאפשר לעותרת להשלים מסמכים שהשמיטה בטענה כי הם מהווים סודות מקצועיים, הגם שדיוני הוועדה חסויים ומסמכים אלו חיוניים לצורך בדיקת סבירות עלויות ההקמה (כגון: כתבי כמויות, מסמכי תכנון, התקשרויות עם ספקי משנה לרבות מחירים). חרף הפנייה של ועדת המכרזים לעותרת על מנת שתשלים את המסמכים שהושמטו, החליטה העותרת שלא להעבירם, לפיכך לא ניתן היה לבחון טענות אלו.