מלכה חזר על גרסתו החדשה - שבהמשך אומתה, כאמור, בעדויות של עורכי דינו כרמלי וברטל - בחקירתו הנגדית המשלימה בבית המשפט. בדיון מיום 7.9.2022 העיד מלכה כי עוד לפני הגשת כתב האישום התקיים משא-ומתן בו הוא הציב את "המשא" והמחלקה לחקירות שוטרים את "המתן"; כבר באותו שלב הייתה הסכמה בעל-פה בינו לסעדה כי הוא יודה בחשדות ולאחר מכן ייחתם עמו הסכם עד מדינה; ואם סעדה היה מפר את ההסכמה בעל-פה ומסרב לאחר הגשת כתב האישום לחתום על ההסכם, מלכה היה חוזר בו מההודאה בבית המשפט ומנהל משפט (עמ' 21353-21352).
- עדויותיהם של עורכי דינו של מלכה, ועמן גרסתו החדשה של מלכה עצמו, שהונחו לראשונה בפני בית המשפט קרוב לשמונה שנים לאחר תחילת המשפט, הפכו על פיה את תמונת המצב באשר למעמד העובדתי והמשפטי של מלכה כעד שמסר גרסה מפלילה נגד פישר ויתר הנאשמים. אמנם, כבר לאחר הסבב הראשון של עדות מלכה בבית המשפט בשנת 2018, ניתן היה להיווכח בכשל חמור שנפל בהתנהלות המחלקה לחקירות שוטרים, שנמנעה מלגלות להגנה את קיומו של מסמך ההבנות בחתימת סעדה ועו"ד ברטל אותו מסר שפיצר לעיון מלכה קודם לתחילת החקירה מיום 19.5.2015; לא הזכירה מסמך זה ברשימת חומר החקירה על אף שמדובר בחומר חקירה מובהק אותו חובה על התביעה להעמיד לעיון ההגנה (סעיף 12(א) להנחיית היועץ המשפטי לממשלה מס' 4.2201 'עד מדינה'); טענה כי אינה נוהגת לתעד משא-ומתן עם באי-כוח של מועמד להיות עד מדינה וכי העבירה להגנה את כל החומר שנמצא ברשותה בנוגע למשא-ומתן עם מלכה; והתמידה במחדליה אלה גם לאחר שניתנה (בפברואר 2018) החלטת בית המשפט שחייבה אותה לאתר את המסמך ואת התיעוד הקשור בעריכתו. אכן, ראש צוות החקירה, שרצר, אישר אף הוא בעדותו כי "כמובן אם אין את הנייר הזה זה תקלה אין שאלה בכלל. זה לא אמור לקרות. זה תקלה" (עמ' 16131-16130); "ההסכם הזה נעלם אני מסכים... אני מסכים שזה צריך להיות בפניכם, אני מסכים שזה לא אמור להיעלם מתיק החקירה" (16831-16830; ראו עוד עמ' 16739-16738, 16964).
דא עקא, שרצר סיפר בעדותו רק חלק מהאמת, והכחיש עובדות שהוכחו באופן פוזיטיבי ושבהן נעוץ חוסר החוקיות המהותי בהסתמכות המחלקה לחקירות שוטרים על ההודעות שגבתה ממלכה טרם הגשת כתב האישום. לצד הודאתו בקיומו של סיכום כתוב בין סעדה לבאי-כוחו של מלכה קודם להסכם עד המדינה מיום 4.6.2015, דבק שרצר בעקביות בטענה שהסיכום האמור נערך רק לאחר הגשת כתב האישום, וכי עד להגשת כתב האישום (14.5.2015) לא נערך משא-ומתן כלשהו בין המחלקה לחקירות שוטרים למלכה. בלשונו: "ביום שבו ערן בא ב-4 למאי והתחיל לשתף פעולה אף אחד לא הבטיח לו דבר ואף אחד לא ניהל אתו שום משא ומתן להיות עד מדינה... אנחנו לא רצינו להגיע למצב שערן לוכד אותנו בסוג של משא ומתן שתוקע את החקירה, ממש לא" (16126, 16131; וכן 16738, 16962-16959, 17344, 17365, 17549). שרצר הוסיף כי פרקליט המדינה הוא שאסר על המחלקה לחקירות שוטרים לנהל עם מלכה משא-ומתן עד להגשת כתב האישום, בעקבות הלקחים שהופקו מפרשת הרב פינטו (16136-16131), וכי עובדות אלה מצויות בידיעתו האישית של שרצר מתוקף היותו ראש צוות החקירה, ובהינתן ש"אף אחד לא מנהל משא ומתן עם מישהו על עד מדינה בלי שראש צוות החקירה יודע מזה" (16127).