- הפערים שנוצרו בין "הנתונים היבשים" שהצביעו על הפחתה משמעותית בפליטת הריחות מהמפעל, כתוצאה ממאמצים שהשקיעה העותרת לבין תלונות התושבים, הצדיקו בחינה זהירה ומדוקדקת של רשות הרישוי באשר למטרדי הריח כתוצאה מפעילות המפעל. לצורך כך, פנתה רשות הרישוי אל המשרד לשם קבלת חוות דעת מייעצת, בטרם תשקול רשות הרישוי אם להפעיל את סמכויותיה ולשלול את רישיון העסק של העותרת, בהתאם להחלטה מחודש יולי בשנת 2014 [נספח 17 לעתירה].
- ביום 20.04.2015 השיב מנהל מחוז המרכז במשרד לפנייתו של ראש רשות הרישוי, בעניין בחינת מטרדי הריח ממפעל העותרת. כעולה מתשובת מנהל המחוז, בשל האפשרות לסגירתו של המפעל מצד אחד ובשל הפוטנציאל למפגע משמעותי בתושבי הסביבה מצד שני, ערך המשרד בדיקות מקיפות. המשרד בחן את תלונות התושבים והצליב אותן עם בדיקות עובדי העירייה. בנוסף, נבחנו הממצאים עם חברת מטאו-טק אשר פיתחה מתודולוגיה בעלת דיוק גבוהה לגילוי ריח שאחראי על מפגע סביבתי. המתודולוגיה הצביעה על המפעל כמקור הריח בתלונות התושבים.
בנוסף, הופעל מודל AERMOD שמאפשר חישוב ריכוזי ריח בסביבה. המודל הופעל על מדידות במקורות ריח של המפעל. המודל הופעל באופן שמרני ונמצא כי הוא מצביע "על קיום מפגעי ריח רציניים בתנאים מטאורולוגיים מסוימים בשכונה הירוקה בכפר סבא". מסקנתו של מנהל מחוז המרכז במשרד הייתה כי "גם לאחר שבוצעו שיפורים למניעת מפגעי הריח ממפעל "בראון", תושבי שכונת כפר סבא הירוקה סובלים ממפגעי ריח שמקורם במפעל זה" [נספח 54 לתגובת העירייה].
- לנוכח ממצאי המשרד מהם עלה כי תושבי השכונה אכן סובלים, כטענתם, ממטרדי ריח בגין פעילות המפעל, הודיעה רשות הרישוי, ביום 28.04.2015, כי בהתאם להחלטה הראשונה ולאחר שניתנו לעותרת די אורכות בכדי להסדיר את מפגע הריח, בכוונת רשות הרישוי לבטל את רישיון העותרת. לעותרת נמסרו חוות דעתו של מנהל מחוז המרכז במשרד וכן העתק של תלונות התושבים, כפי שהתקבלו במוקד העירוני. לעותרת ניתנה האפשרות למסור לרשות הרישוי "מכתב השלמת טיעוני השימוע, וזאת עד ליום 4.5.15 בשעה 16:00" [נספח 55 לתגובת העירייה].
- העותרת נזעקה לנוכח פרק הזמן הקצרצר שהוקצה לה להשלמת השימוע. אולם, בקשותיה לקבל ארכה בת שבעה ימים נוספים – נדחו [נספחים 57-56 לתגובת העירייה וכן נספח 20 לעתירה]. בסופו של יום, התכנסו נציגי רשות הרישוי לדיון בעניינה של העותרת בלא שהעותרת הניחה לפני רשות הרישוי את השלמת טיעוניה. בדיון זה נכח, פרט לגורמי רשות הרישוי ויועציה המשפטיים, גם מר אבי מושל.
- מר מושל, המתמחה כאמור בתחום מפגעי אוויר וריח ואף שימש בעבר בתפקיד בכיר בתחום איכות האוויר במשרד, ערך חוות דעת מקיפה ומפורטת נושאת תאריך 4.05.2015. כעולה מפרוטוקול הדיון מיום 5.05.2015, פרט לחוות דעתו של המשרד מיום 20.04.2015, הייתה לפני נציגי רשות הרישוי גם חוות דעתו של מר מושל.
חוות דעת זו התבססה על ארבעה דיגומי ריח שבוצעו במפעל העותרת בתאריכים נובמבר 2013 ועד לחודש ינואר 2015, על תלונות התושבים בתקופה שבין חודש יוני 2014 ועד לחודש אפריל 2015, על דוחות פיקוח של עובדי העירייה (שעברו הכשרת "צוות מריחים") ועל שלושה ביקורים שערך מר מושל במפעל ובסביבתו.