65. מטבע הדברים, קיים לא פעם מתח בין העקרונות השונים העומדים בבסיס דיני המיסים. העקרונות האמורים עשויים להתנגש אלו באלו. בעת פרשנות הוראות חוק, מוטל על בית המשפט לאזן בין העקרונות השונים ולבחור בפרשנות אשר עולה בקנה אחד עם לשון החוק ותכליתו. על בית המשפט לבחון לאילו מהעקרונות יש להעניק מעמד בכורה, בהתאם לתכליות שעמדו בבסיס חקיקת החוק ועמדתו של המחוקק.
66. בתי המשפט הכירו בכך שבין תכליותיה של פקודת מס הכנסה מצויים שמירה על חופש הפרט ועל הקניין, תשלום מס אמת, הגשמת זכויות יסוד של השיטה הכוללת זכויות חוקתיות, קידומו של ערך השוויון, קידום מושגים מקובלים של צדק, חלוקה צודקת של נטל המיסים, מניעת כפל מס, הגשמת תוצאות סבירות והכרה בזכותו של הנישום לכלכל מעשיו באופן שיביא לנטל מס קטן ולחסכון במס. אולם, יש מקרים בהם יעדיף בית המשפט פתרונות מעשיים אשר מבוססים על יעילות, פשטות ומניעת התדיינויות משפטיות על פני פתרונות מדוייקים, אם הם מורכבים ומסובכים במידה לא ראויה (יוסף אדרעי, "מבוא לתורת המיסים – על מקורותיה, עקרונותיה, תכליתה והגיונה", הוצאה לאור של לשכת עורכי הדין, תשס"ט-2008, עמ' 92-93).
67. בית המשפט העליון קבע, כי בבואנו לפרש הוראות מס, אין להקל ראש בתכליות של יעילות, וודאות ויציבות, אשר עמדו לנגד עיניו של המחוקק. נקבע, כי במקרים בהם המחוקק בחר לתת בכורה לשיקולים של יעילות, וודאות ופשטות בעת חקיקת חוק כלשהו, הרי שאל לו לבית המשפט להתערב בסדר העדיפות אשר קבע המחוקק בין התכליות השונות ואין לסטות מסדר העדיפות האמור (ע"א 8569/06 מנהל מיסוי מקרקעין חיפה נ' אלברט אברהם פוליטי, פ"ד סב(4), 280).
68. במקרה אשר נדון במסגרת פרשת פוליטי, נחלקו הצדדים בשאלה, האם ניתן לסטות מנוסחת החישוב הלינארי אשר נקבעה בחוק מיסוי מקרקעין (שבח ורכישה), תשכ"ג-1963. בית המשפט העליון קבע, כי קבלת עמדתו של המנהל, לפיה אין לסטות מנוסחת החישוב הלינארי, תגשים תכליות של יעילות, וודאות ויציבות, אשר עמדו ביסוד בחירתו של המחוקק ואשר עומדים ביסודם של דיני המס בכלל. אכן, בית המשפט ציין, כי כאשר עסקינן בנוסחה הקובעת מהו הרווח שהופק, עלול להיווצר מצב בעייתי בו יוטל מס על רווח שלא הופק. עם זאת, אין באמור בכדי לשלול, כי במקרים בהם בחר המחוקק להעניק בכורה לשיקולים של יעילות, תוך קביעת כללים לקביעת הרווח שהופק, תינתן עדיפות לשיקול זה.