ביום 22.2.16 הגישו העותרים בעתירת אלוני את תגובתם לערר הוועדה המקומית כנגד החלטת הוועדה המחוזית (ראו נספח 31 לעתירת אלוני) וביום 5.10.16 הגישה הוועדה המחוזית גם היא תגובתה לערר (ראו נספח 1 לתגובת וועדת המשנה לעררים והוועדה המחוזית לעתירות).
וועדת הערר דנה בערר ביום 6.4.17, והצדדים השמיעו טיעוניהם לפניה. במהלך הדיון, דנה ועדת הערר, בין היתר, בשאלת היקף טיעוני העותרים בעתירת אלוני, בהתאם לתקנה 10 לתקנות הערר. הוועדה החליטה לתקן את תשובתם, כך שיימחקו בה טענות שלא הופיעו בערר הוועדה המקומית. זאת, שכן מעמדם בערר הינו של משיבים בלבד. ואולם, כחריג להחלטה זו, החליטה הוועדה שכן לדון בטענה שהעלו העותרים בעתירת אלוני, ושלא הועלתה בערר הוועדה המקומית - לפיה לא קוימו הוראות תמ"מ 5 ביחס לציר ז'בוטינסקי, וביחס לעיגון הציר הירוק בהוראות התכנית. זאת, בעיקר לנוכח חשיבות הטענה ועל מנת לייעל את הדיון (ראו העתק תמליל דיון ועדת המשנה לעררים מיום 6.4.17 בנספח 2 לתגובת וועדת המשנה לעררים והוועדה המחוזית לעתירות).
ביום 27.6.17 ניתנה החלטת וועדת המשנה לעררים, במסגרתה הוחלט פה אחד לדחות את הערר כולו ואת טענות העותרים בעתירת אלוני, ולהותיר על כנה את החלטת הוועדה המחוזית לאשר את תכנית שתיל (ראו העתק החלטת ועדת המשנה לעררים של המועצה הארצית מיום 27.6.17 בנספח 1 לעתירת אלוני).
במסגרת החלטתה מיום 27.6.17, החליטה וועדת המשנה לעררים כי תנאי לפרסום התכנית למתן תוקף יהא דיון בתכנית על ידי הוועדה המחוזית. זאת, על מנת שהוועדה המחוזית תנמק מדוע יש לפרסם את התכנית למתן תוקף חרף הצפיפות הנמוכה המוצעת בה, הנמוכה מצפיפות המינימום שנקבעה בתיקון מס' 1 לתמ"א 35. תיקון זה, שעוד יידון בהמשך פסק הדין, נכנס לתוקפו רק לאחר אישורה המקורי של התכנית. הוראת המעבר שנקבעה בו, קובעת כי ניתן לאשר תכנית שהופקדה טרם אישורו אף שאינה תואמת את הוראותיו, לאחר שמוסד תכנון קיים בה דיון והחליט לאשרה מנימוקים שיירשמו, והתקבל אישורה של הוועדה המחוזית.
בהתאם, ביום 4.9.17 התקיים דיון בוועדה המחוזית, במסגרתו שבה ונבחנה סוגיית צפיפות יחידות הדיור. הוועדה המחוזית חזרה על החלטתה הקודמת והותירה על כנה את הצפיפות שנקבעה בתכנית שאושרה על ידה. הוועדה המחוזית נימקה את החלטתה, בין היתר, ברצונה להתחשב בעמדת הוועדה המקומית והמתנגדים האחרים לתכנית, וברצונם לשמור על צביון השכונה (ראו העתק פרוטוקול והחלטת הוועדה המחוזית מיום 4.9.17, בנספח 4 לעתירת אלוני).